I det mikrobiologiske laboratorium identificeres, kvantificeres og karakteriseres mikroorganismer i komplekse miljøprøver. Der arbejdes med alle gængse standard teknikker indenfor mikrobiologi og molekylær biologi (PCR, QPCR, DGGE, SSCP og FISH, ATP bestemmelse) og laboratoriet er godkendt til at arbejde med GMO1 organismer og pathogener i klasse 2.
Investeringer indenfor molekylær biologi og mikroskopi har gjort dette laboratorium veludstyret til at kvantificere tilstedeværelse, diversitet og dynamik af komplekse mikrobiologiske samfund.
Præcise beskrivelser af biofilm kan udføres med scanning confocal mikroskop anvendt sammen med FISH teknik og efterfølgende billedanalyse.
Laboratorieansvarlig tekniker: Lene K. Jensen